建大规划院下设有院长室、副院长室、总工室、行政办、总工办、经营办、生产办、保密室、档案室、规划一所、规划二所、规划三所、规划四所、规划五所、城市与区域经济研究所、策划与规划研究所、旅游规划研究所、风景园林研究所、环境艺术研究所、历史文化保护研究所、建筑与环境研究所、城乡规划与设计研究中心、历史文化名城研究中心。